中国科学院福建物质结构研究所
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中国科学院地球化学研究所
中国科学院地球化学研究所(以下简称“地化所”)成立于1966年2月，由中国科学院地质研究所地球化学研究室、昆明地质工作站和中国科学院贵阳化学所等单位合并组成。
中国科学院武汉岩土力学研究所
中国科学院武汉岩土力学研究所（以下简称武汉岩土所）创建于1958年，是专门从事岩土力学基础与应用研究、以工程应用背景为特征的综合性研究机构。
中国科学院南京地质古生物研究所
中国科学院南京地质古生物研究所成立于1951年，其前身为前中央研究院地质研究所及前中央地质调查所等机构的古生物室(组)，目前是我国唯一的从事古生物学(古无脊椎动物学与古植物学)和地层学研究的专业机构。
中国科学院昆明植物研究所
中国科学院昆明植物研究所（以下简称“昆明植物所”）是中国科学院直属科研机构，是我国植物学、植物化学领域重要的综合性研究机构。昆明植物所以“原本山川 极命草木”为所训，旨在认识植物、利用植物、造福于民。
中国科学院地球环境研究所
中国科学院地球环境研究所以黄土-粉尘-气溶胶为纽带，开展环境变化的过程、规律、机制、趋势与可持续性研究，面向世界科技前沿，为国际地球系统科学发展做出创新性贡献，面向国家战略需求和国民经济主战场.
中国科学院过程工程研究所
中国科学院过程工程研究所前身是1958年成立的中国科学院化工冶金研究所。五十多年来，研究范围逐步扩展到能源化工、生化工程、材料化工、资源/环境工程等领域，学科方向由“化工冶金”发展为“过程工程”。
中国科学院理论物理研究所
理论物理所自进入知识创新试点工程基地以来，以探索自然界物质结构以及基本运动规律方面做出具有国际影响的重大创新成果为目标，对学科方向作了进一步的凝炼，形成了六个研究方向，研究领域涉及到物质起源和基本组元，宇宙起源和演化，生命起源和进化。
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