科学家开发出细胞外囊泡数据库

近日,中国科学院动物研究所、城市环境研究所开展多学科数据交叉合作,共建细胞外囊泡数据库。相关成果以EV-COMM: A database of interspecies and intercellular interactions mediated by extracellular vesicles为题,发表在Journal of Extracellular Vesicles上。

细胞外囊泡(EVs)是由生物体分泌的纳米级颗粒,通过携带、传递RNA、蛋白质和代谢产物等功能分子,介导环境与生物体、生物体之间的互作,成为广受关注的信号通讯载体。已有EVs数据库关注EVs中的功能分子,但没有纳入互作的物种信息,缺乏EVs介导的完整互作知识链条数据,无法满足相关领域的数据需求。

该研究利用环境健康主题数据库在环境胁迫数据、胞外囊泡数据方面的积累和中国动物主题数据库在物种信息、物种合作方面的数据积累,开发了细胞外囊泡数据库,收集、整合和展示了细胞外囊泡介导的1400多条相互作用事件,涵盖蛋白质、脂质、DNA、RNA四种功能分子,213种生物体,46种组织/器官。

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科学家开发出细胞外囊泡数据库

EVs介导的物种互作示意图

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